Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Smg9Q9DB90 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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