Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn22Q9D7U6 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms