Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D4W2 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D4W2 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms