Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snx20Q9D2Y5 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms