Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms