Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Otud1Q9CUB6 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otud1Q9CUB6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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