Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fcf1Q9CTH6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms