Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ciao1Q99KN2 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ciao1Q99KN2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms