Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pacsin3Q99JB8 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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