Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Apobec3Q99J72 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Apobec3Q99J72 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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