Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Usp27Q8CEG8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usp27Q8CEG8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms