Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pramef8Q8CE24 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms