Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ssuh2Q8C3L1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms