Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms