Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trim35Q8C006 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trim35Q8C006 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trim35Q8C006 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trim35Q8C006 1700061E17Rik-201ENSMUST00000185439 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trim35Q8C006 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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