Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Pkp4Q68FH0 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pkp4Q68FH0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pkp4Q68FH0 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Pkp4Q68FH0 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkp4Q68FH0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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