Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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