Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Usp30Q3UN04 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Usp30Q3UN04 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Usp30Q3UN04 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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