Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Edc4Q3UJB9 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Edc4Q3UJB9 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms