Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Otud5Q3U2S4 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Otud5Q3U2S4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Otud5Q3U2S4 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Otud5Q3U2S4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Otud5Q3U2S4 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Otud5Q3U2S4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms