Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Dis3l2-201ENSMUST00000065694 3085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Lyrm7os-201ENSMUST00000154044 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Olfr1090-203ENSMUST00000217043 2054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Olfr169-202ENSMUST00000215040 2316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 I830077J02Rik-201ENSMUST00000098758 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Irx6-202ENSMUST00000167261 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccbe1Q3MI99 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms