Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms