Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm14276-201ENSMUST00000117941 720 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm16365-201ENSMUST00000122987 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Iqcf5-201ENSMUST00000085113 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Sfta2-201ENSMUST00000171166 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Mir6909-201ENSMUST00000184212 62 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TrioQ0KL02 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm37261-201ENSMUST00000194360 1101 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Slc51b-201ENSMUST00000065894 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm19114-201ENSMUST00000193972 1357 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TrioQ0KL02 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms