Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc21bQ0HA38 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc21bQ0HA38 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms