Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Cdx4Q07424 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Cdx4Q07424 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms