Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm13999-201ENSMUST00000141511 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms