Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm13874-202ENSMUST00000135348 941 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 1500004A13Rik-205ENSMUST00000184014 2135 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Ccl7Q03366 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms