Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NfiaQ02780 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NfiaQ02780 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms