Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gjb2Q00977 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms