Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Stx2Q00262 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms