Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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