Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Usp46P62069 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Usp46P62069 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms