Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nphp4P59240 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms