Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms