Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
TgfaP48030 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
TgfaP48030 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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