Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rpl28P41105 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms