Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Calhm1-201ENSMUST00000111813 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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PtprmP28828 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ccdc173-201ENSMUST00000094942 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PtprmP28828 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PtprmP28828 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PtprmP28828 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PtprmP28828 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm5910-201ENSMUST00000211819 1746 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PtprmP28828 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PtprmP28828 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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