Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxd12P23812 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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