Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa-rs1P17533 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa-rs1P17533 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms