Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Calb1P12658 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Calb1P12658 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms