Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm34664-202ENSMUST00000207661 1032 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Tpt1-ps5-201ENSMUST00000112150 516 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms