Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Dnmt3cP0DOY1 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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