Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PdgfrbP05622 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms