Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Zfp870J3QMA4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms