Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm8005F6YKY3 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms