Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm42421F6X8D5 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm42421F6X8D5 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms