Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc8E9PWG2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc8E9PWG2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms