Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms