Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms