Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms